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采用纳米孔技术的全基因组测序

使用长读长纳米孔测序完整的微生物、人类、动物和植物基因组。纳米孔测序能够以更少的重叠群(contig)提供更长的连续序列,读长序列之间的重叠部分更大,从而强化基因组组装。使用纳米孔长读长还能够准确解析结构变异和重复区域,并鉴定碱基修饰、融合基因和单倍型分型。
  • 使用长读长准确解析结构变异、重复区域和单倍型分型
  • 使用长读长简化从头组装并校正参考基因组
  • 精简的快速文库制备工作流程,起始量需求低
  • 通过直接测序探索表观遗传修饰,消除偏好性
  • 通过实时碱基识别和分析,在获得足够深度时即可以停止测序
  • 使用 Flongle, MinION, GridION 或 PromethION 扩展您的需求

您可以如何使用纳米孔技术?

微生物基因组

人类基因组

动物基因组

植物基因组

使用纳米孔长测序读长获得完整的细菌、病毒和真菌 DNA 或 RNA 基因组。在实验台或现场对复杂的宏基因组样本进行准确的种属鉴定和基因组组装。综合分析具有挑战性的基因组区域,如结构变异和重复,以获得高质量组装。
  • 使用长测序读长准确解析结构变异和重复区域
  • 使用从组装头或有参考基因组的方法获得完整的基因组,并校正参考组装
  • 直接测序 RNA 病毒基因组,避免偏好性
  • 在疫情爆发点使用便携式 MinION,通过实时分析快速实施全面的病原体检测和菌株鉴定
  • 直接同步识别表观遗传修饰和核苷酸序列
  • 在单条读长中测序整个质粒和病毒,无需组装
”重复序列和极端的 GC 含量对使用短读长技术进行的基因组组装提出了挑战。我们的结果表明,使用单分子、长读长测序技术(例如 Oxford Nanopore MinION)可以在很大程度上克服这些困难。“
使用纳米孔长和超长读长获得人类基因组完整的端粒到端粒组装。通过准确解析结构变体和断裂点、对单倍型进行定量以及在具有挑战性的重复区域(如着丝粒)进行测序,充分鉴定人类遗传变异。使用一系列纳米孔测序平台进行个体或群组规模的全基因组测序研究,满足您的需求。
  • 使用从头组装或有指导参考基因组的方法获得完整且连续的基因组组装
  • 识别并综合鉴定临床研究样品中疾病特异性变异,并快速获得结果
  • 准确解析结构变体、断裂点和重复区域
  • 研究单倍型分型和基因连锁
  • 通过直接测序检测表观遗传修饰,并消除 PCR 偏好性
  • 根据您的需求扩张规模:30 Gb MinION;150 Gb GridION;4,800/9,600 Gb PromethION P24/P48
使用纳米孔长读,可完成模式生物和非模式生物的完整基因组组装。 全面了解动物物种的遗传变异和进化,从而促进疾病研究,并对动物育种产生积极影响。 使用纳米孔长读长和超长读长,可充分鉴定宿主和病原体的基因组,包括对结构变体、重复区域和转座因子的解析。
  • 使用从头或有参考基因组的方法获得完整的基因组,并校正参考组装
  • 准确解析结构变体、重复区域和定相(phasing)
  • 利用便携式 MinION 在实验台或野外快速测序和鉴定动物病原体
  • 使用直接测序检测表观遗传修饰,消除 PCR 偏好性
  • 根据您的需求扩展—— 30 Gb MinION; 150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48
由于植物基因组庞大、高度重复、并表现出多种倍性的特点,使用短读长测序技术对植物基因组进行测序和组装具有挑战性。 纳米孔长读长和超长读长强化了植物基因组的组装,并使得大型结构变体、重复区域和转座因子得以解析。
  • 准确解析较大的结构变异和重复
  • 使用从头或有参考基因组的方法,组装完整的基因组和正确的参考基因组
  • 从简单或复杂的宏基因组样本中快速实时检测和鉴定植物病原体,利用便携式 MinION 在现场进行检测
  • 直接鉴定表观遗传修饰,并消除 PCR 偏好性
  • 研究单倍型定相和基因连锁
  • 根据您的需求扩展——30 Gb MinION; 150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48
“ PromethION是真正的游戏规则改变者,将超长读长与高测序产量相结合,可产生连续的高质量参考基因组。使用该平台,我们仅需几张测序芯片就对 2.56 Gb 大小的生菜基因组以 >100X 的覆盖度进行了测序。”
PromethION 测序服务提供商,KeyGene,Alexander Wittenberg