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Genomics England 将在癌症基因组分析中评估 Oxford Nanopore 的实时高通量 DNA 测序技术
18 May 2021
Genomics England 将使用 Oxford Nanopore 的 PromethION 48 测序仪对数千个人类基因组进行测序，该项目将对其在癌症基因组学方面提供快速、丰富见解的潜力进行评估。
该项目作为英国政府资助 Genomics England 的开创性工作的新承诺的一部分，将建立在 Genomics England 重要纳米孔测序专业知识发展的基础上。Genomics England 已建立了使用 PromethION 分析全人类基因组的管道流程，该流程作为计划的一部分，将研究不同严重程度的新型冠状病毒感染的潜在遗传起源。
该项目属于 Genomics England 一系列癌症基因组学项目的一部分，旨在探索各种新技术和方法对改善癌症结果的潜在影响，其中包括使用长读长和甲基化技术。
建立综合图谱
癌症是一种 DNA 改变引发的基因组疾病。对癌症患者的肿瘤和健康细胞进行测序，从中获得的信息可以改善诊断，并帮助临床医生选择对个体案例最为可能有效的治疗方法。全基因组测序还可显示哪些患者不太可能受益于哪些特定治疗，从而节省不必要的治疗和毒副作用。
迄今为止，基因组测序提供见解对癌症患者常规护理的影响颇为有限。这是由于现有技术对肿瘤中一系列重要遗传变化类型的检测速度未能对治疗产生影响。
使用 Oxford Nanopore 的高通量测序设备，这些遗传变化能够被实时检测，其中包括遗传材料的大型重排或“表观遗传”修饰。
这项新的研究将调查纳米孔测序设备为肿瘤基因组生成真正全面图谱，并以足够快的速度将结果转化为对临床医生及其患者有用见解的潜力。
Oxford Nanopore Technologies 首席执行官 Gordon Sanghera 表示：
“该研究项目将调查的是癌症样品测序的重要方面。这些分析需要快速周转，以确保获得最佳的治疗效果。我们的实时设备可以进行快速分析，同时还能够将大量的信息以丰富的数据形式提供呈现。我们很高兴与 Genomics England 的专家合作来了解 PromethION 可能产生的潜在影响。”
PromethION 是 Oxford Nanopore 的最高通量设备。通过长读长序列和甲基化分析，交付丰富的数据，为科学家提供分析人类基因组的能力。使用 PromethION，可以扩展到 Tb 级别的海量数据，以满足实验的需求。
了解更多有关PromethION信息：https://store.nanoporetech.net/promethion.html
了解更多如何运用纳米孔测序技术研究癌症基因组：https://nanoporetech.net/applications/research_areas/cancer-research-and-sequencing