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Oxford Nanopore 宣布LamPORE法进入后期研发,用于快速、高度可扩展、低成本的COVID-19分析

22 May 2020

英国牛津,2020年5月22日
Oxford Nanopore Technologies公司针对引发新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的SARS-CoV-2病毒开发的新一代端到端分析法已进入后期阶段。
LamPORE分析法快速、低成本,其可扩展性能够满足对较小样品数至大量样品量的按需分析。硬件和试剂不在已告急的用于其它分子检测的紧张供应链之中。
LamPORE-device
LamPORE在Oxford Nanopore的DNA/RNA测序技术上,结合了一套简单、低成本、快速的样本制备方法(环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification, LAMP),加上Oxford Nanopore的快速建库试剂盒)。它寻求了解样品中是否存在SARS-CoV-2病毒,而非可能表明存在过去感染的抗体。
自SARS-CoV-2病毒兴起之始,Oxford Nanopore快速、便携的测序技术便已经被大量地应用在COVID-19流行病学和科学研究中。
LamPORE实验方案将被开放用于任何在Oxford Nanopore设备上进行的科学研究。
Oxford Nanopore的愿景是支持对SARS-CoV-2病毒的识别、追踪、溯源和隔离等各项努力, LamPORE分析法的设计旨在实现快速识别SARS-CoV-2病毒——不论是在高通量、中心化的实验室处理上千个样本,或是在分散地点的按需分析,因此能够实施于更多的社区环境中。
高通量的LamPORE是为常规的、基于实验室的大规模劳动力筛查而设,无论是用于前线工作人员,或是支持一般大众重回工作岗位。这可能包括对医务健康工作者,其它公共部门的员工或是企业雇员的例行筛查。它还能够部署在地点分散的环境中。随着限制的缓解,LamPORE为实现快速的本地化分析打开了机遇,比如在养老院、交通网络、企业和社区环境中。本地化分析与快速的分析周期相辅相成,是实现快速、精确的隔离并因此防止病毒继续传播的关键。
LamPORE方法也可用于分析环境样本来评估其中是否存在SARS-CoV-2病毒,可潜在用于收集表面拭子或诸如水源处理之类的系统中。
LamPORE不依赖传统COVID-19分析中所使用的试剂,可缓解当前来自供应链的压力,并能够扩大分析的可及性。
 “今年,通过支持将我们的测序技术用于COVID-19流行病学的用户,我们积累了大量丰富的经验,我们也一直将我们强大的创新和开发动力运用于COVID-19。” Oxford Nanopore首席执行官Gordon Sanghera博士说:“我们设计的首款纳米孔测序仪可被任何科学家在任何地方使用。现在,借助LamPORE,我们希望将纳米孔测序的普适性和可扩展性引入快速分析领域。”
Oxford Nanopore正在与多家机构的科学家合作,快速优化和验证用于SARS-CoV-2分析的LamPORE方法。
关于LamPORE
LamPORE方法在SARS-CoV-2病毒分析中可提供的优势:
从简单材料中获得精确结果:凭借简单的硬件要求,LamPORE将成熟、快速、低成本的用于初始病毒扩增的LAMP方法与Oxford Nanopore的测序技术相结合,从而获得精确的数字结果。
LAMP法结合基于颜色的解读已被独立用于病毒检测,然而基于颜色的结果判断具有挑战,在大规模使用时尤甚。
  • 材料容易获取:
    所需试剂成本低,且分离于当前服务RT-PCR系统的供应链。全球当前面临RT-PCR设备和试剂短缺。
  • 可扩展性与快速结果:
    使用分子条码标签(barcode)同时运行多个样本,即可扩大样本数量。使用最小的测序设备MinION,大约1小时可分析96个样本,或在约4.5小时内分析1152个样本。必要时,还可按需分析更为少量的样本。当需要处理大规模样本时,一台中型GridION测序设备在同样的时间内能处理MinION五倍的样本数量。
  • 样本类型:
    我们正在开发该分析法开用于拭子或唾液样本。
  • 分析其他病原体:
    LamPORE方法具备被进一步开发的潜力,用于分析包含SARS-CoV-2病毒在内的多种病原体。这在COVID-19的流行率下降,但其他呼吸道病原体的流行率较高时具有潜在的实用性,可用以在人群中不常见时对SARS-CoV-2病毒的筛查。
您可以点击这里注册您的意向。
LamPORE-workflow
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