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采用纳米孔测序技术的微生物学研究

采用长读长纳米孔测序得到完整细菌、真菌和病毒（DNA 或 RNA）基因组。通过快速检测病原体的方法，从环境或单一生物样品中识别并鉴定微生物——无论是在实验室还是野外。如有需要，可配合使用抗菌药物耐药性分析。使用直接 RNA 或 cDNA 测序方法对全长转录本进行测序，进行准确的基因表达和转录本异构体分析。

使用长读长简化从头组装并校正参考基因组
解析结构变异和重复区域
测序和定量全长转录本，进行明确的基因表达和异构体分析
通过直接测序消除偏好性，并识别表观遗传修饰
实时获取结果，包括物种识别
使用 Flongle, MinION, GridION 或 PromethION 扩展您的需求

您可以如何使用纳米孔技术?

基因组分析

物种鉴定 & 抗微生物抗药性分析

转录组研究

表观遗传学

全面分析微生物基因组（DNA或RNA）。准确定位重复区域和结构变异，并使用长序列读长来区分质粒与基因组区。简化从头组装，并矫正现有的参考基因组。无论是从实验台还是到现场，根据您的需求调整规模。

准确解析具有挑战性的基因组区域（结构变异和重复）
利用长读长简化从头组装，并纠正参考基因组
使用全基因组、靶向测序和混样建库的方法
直接DNA和RNA测序，无需PCR，消除偏好性
通过实时数据流获得即时结果
扩展规模以满足您的需求——1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

全基因组测序开始使用

“重要的是，我们证实，与仅使用短读长的组装相比，基于简单的 10 分钟文库制备方案的单次 MinION 测序运行使基因组连续性增加 67 倍，基因组完整性提高 28%”

Díaz-Viraqué et al

Ultra-deep, long-read nanopore sequencing of mock microbial community standards

Direct RNA sequencing of the coding complete Influenza A virus genome

Nanopore sequencing significantly improves genome assembly of the protozoan parasite Trypanosoma cruzi

实时准确识别微生物和相关的抗微生物抗药性（AMR）。 Oxford Nanopore 提供完整的解决方案：从快速的10分钟文库制备（DNA），到使用 EPI2ME 平台的实时系统发生树和 AMR 分析。使用宏基因组或靶向 16S rRNA 方法。在样品源或实验室，使用便携式 MinION 或台式GridION，或 PromethION 设备进行测序。

使用长读长实时识别微生物和 AMR，并区分密切相关的菌株
使用快速的全基因组或靶向（例如 16S）方法，简化工作流程
使用便携式 MinION 和 Flongle 在样品源处进行测序
混样建库样品获得更具成本效益的结果
扩展规模以满足您的需求——1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

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